El Sindicato de Docentes de la Universidad Austral de Chile se fundó el 11 de julio del año 2007 tras la gestión de integrantes de la Asociación Gremial de Académicos para disponer de una herramienta legal para llegar a acuerdos en un plano de respeto mutuo con las autoridades universitarias.

Cada tres años, con votación universal, se elige al Directorio del SINDOC, el cual es asesorado por diversas comisiones de trabajo. La máxima autoridad de la institución sindical es la Asamblea General.